The genetic code appeared on Earth with the first cells. The codes of cultural evolution arrived almost four billion
years later. These are the only codes that are recognized by modern biology. In this book, however, Marcello Barbieri
explains that there are many more organic codes in nature, and their appearance not only took place throughout the history
of life but marked the major steps of that history. A code establishes a correspondence between two independent 'worlds',
and the codemaker is a third party between those 'worlds'. Therefore the cell can be thought of as a trinity of genotype,
phenotype and ribotype. The ancestral ribotypes were the agents which gave rise to the first cells. The book goes on to
explain how organic codes and organic memories can be used to shed new light
on the problems encountered in cell signalling, epigenesis, embryonic development, and the evolution of language.
Infos about the book
Title : The organic codes - an introduction to semantic biology
Destinés aux étudiants de PAES, cette collection a été conçue pour préparer efficacement les concours de médecine, pharmacie, odontologie et maïeutique.
Adaptés au niveau réel des concours, ils proposent une structure claire sous forme de fiches pour accéder directement à l'information
Chaque partie comporte :
-Un cours complet illustré pour revoir toutes les notions essentielles ;
-Des exercices résolus qui présentent les méthodes et qui permettent de mettre en application les techniques nécessaires
à la résolution des problèmes. Des conseils soulignent les erreurs à éviter ;
-Des annales de concours récents pour s'entraîner ;
-Le corrigé des annales.
Cet ouvrage a été réalisé par une équipe d’enseignants habitués des préparations au CAPES et à l’Agrégation de SVT, ou anciens membres du jury des concours.
Les annales réalisées par les membres du jury étant largement documentées en ce qui concerne les épreuves écrites, l’objectif de cet ouvrage est essentiellement
d’aider les étudiants à préparer les épreuves orales. Seules quelques épreuves écrites sont analysées ici.
L’ouvrage est découpé en trois parties principales, correspondant aux besoins principaux des étudiants :
-réaliser un plan en fonction du titre d’une leçon ;
- maîtriser les connaissances essentielles relatives au sujet ;
- savoir illustrer ses propos.
Dans la partie « Leçons », 88 leçons portant sur les différents domaines des sciences de la vie sont traitées.
Pour chacune de ces leçons, le cadre et les objectifs sont rapidement décrits.
Ils permettent de situer le sujet par rapport au contexte ou à d’autres sujets voisins du même domaine de connaissances.
Une liste d’illustrations possibles est ensuite donnée à titre indicatif. Cette dernière ne se veut pas exhaustive,
mais énumère les éléments indispensables à une illustration pédagogique de la leçon.
Un plan d’organisation des connaissances est proposé. Il ne s’agit que d’un exemple et non d’un modèle. Le meilleur plan
reste celui conçu par le candidat en fonction de sa « vision » du sujet.
L’objectif est ici de balayer, de manière pédagogique, l’ensemble des connaissances concernant la leçon.
Compte tenu du volume de l’ouvrage, chaque plan est limité à une double page mais une icône dans la marge renvoie vers des pages de « Connaissances ».
Une figure ou un tableau focalise l’esprit du lecteur sur un élément essentiel de la leçon. Il est souvent conseillé au candidat de laisser, en fin de leçon,
un tableau bien tenu, contenant au moins un schéma. La figure proposée ici pourrait être ce dernier.
Dans la partie « Connaissances », 78 « fiches » résument les principales notions abordées en sciences de la vie. Il n’est pas
question ici de résumer l’ensemble des connaissances ou de plagier les meilleurs ouvrages. Ces derniers doivent être connus des
candidats et les fiches présentées ici n’ont pour objectif que de résumer rapidement une notion ou de rappeler quelques faits.
Un renvoi vers la bibliographie est développé au début de chacune des leçons.
Dans la partie « Travaux pratiques », les principales manipulations possibles lors d’une leçon sont décrites.
Une navigation permanente entre ces parties, par le biais des icônes localisées dans les marges,permet au lecteur de retrouver rapidement :
- un rappel de connaissances évoquées dans une leçon ;
- le protocole expérimental d’une manipulation ;
- une autre leçon abordant des notions voisines ou complémentaires.
L’étudiant préparant une leçon pourra donc en quelques minutes, retrouver l’ensemble
des connaissances impliquées dans une leçon, ainsi que les leçons voisines faisant appel au même domaine scientifique
Title : Sciences de la vie pour le CAPES et l'agrégation : Leçons corrigées, rappels des connaissances, travaux pratiques, sujets d'écrit corrigés
author(s) : Daniel Richard, Patrick Chevalet, Nathalie Giraud, Fabienne Pradere, Thierry Soubaya
The electron transport chain in the mitochondrion is the site of oxidative phosphorylation in eukaryotes.
The NADH and succinate generated in the citric acid cycle are oxidized, releasing energy to power the ATP synthase.
Oxidative phosphorylation is a metabolic pathway that uses energy released by the oxidation of nutrients to produce adenosine triphosphate (ATP).
Although the many forms of life on earth use a range of different nutrients, almost all carry out oxidative phosphorylation to produce ATP,
the molecule that supplies energy to metabolism. This pathway is probably so pervasive because it is a highly efficient way of releasing
energy, compared to alternative fermentation processes such as anaerobic glycolysis.
During oxidative phosphorylation, electrons are transferred from electron donors to electron acceptors such as oxygen,
in redox reactions. These redox reactions release energy, which is used to form ATP. In eukaryotes, these redox reactions
are carried out by a series of protein complexes within mitochondria, whereas, in prokaryotes, these proteins are located
in the cells' inner membranes. These linked sets of proteins are called electron transport chains. In eukaryotes, five
main protein complexes are involved, whereas in prokaryotes many different enzymes are present, using a variety
of electron donors and acceptors.
The energy released by electrons flowing through this electron transport chain is used to transport protons across the inner
mitochondrial membrane, in a process called chemiosmosis. This generates potential energy in the form of a pH gradient and an
electrical potential across this membrane. This store of energy is tapped by allowing protons to flow back across the membrane
and down this gradient, through a large enzyme called ATP synthase. This enzyme uses this energy to generate ATP from adenosine
diphosphate (ADP), in a phosphorylation reaction. This reaction is driven by the proton flow, which forces the rotation of a part
of the enzyme; the ATP synthase is a rotary mechanical motor.
Although oxidative phosphorylation is a vital part of metabolism, it produces reactive oxygen species such as superoxide and hydrogen
peroxide, which lead to propagation of free radicals, damaging cells and contributing to disease and, possibly, aging (senescence).
The enzymes carrying out this metabolic pathway are also the target of many drugs and poisons that inhibit their activities.
Title : Advanced concepts of energy transformation in metabolism biochemistry
This handbook, which in its early lustrous years served physicians, pharmacists, and pharmacy students, is
unlike any other drug reference book in that it allows readers to compare and contrast various drugs within
drug categories, thereby enabling them to make decisions on which drug to administer. All other drug reference
books merely repeat the drug manufacturers' literature, with no analysis of that information. Nor are there any
reports from the published literature concerning use and efficacy of the drugs listed. The clinical drug information
with part II contains chapters on drug-induced diseases, drug interactions and interferences, drug use in special populations, immunization, medical emergencies, and nutrition support.
There are also appendices that contain useful conversion factors, anthropometrics, and laboratory indices.
